食品微生物是與食品有關的微生物的總稱。包括消費型食品微生物（醋酸桿菌，酵母菌等）和食物蛻變（霉菌，細菌等）和食源性病原微生物（大腸桿菌，肉毒桿菌等）。食源性病原微生物惹起的食源性疾病是食品平安的中心效果。食源性病原微生物可經過接觸物外表、水、土壤、空氣、排泄物、食物等媒介傳達，從而污染“從農田到餐桌”的食物鏈任何環節。由于其種類單一、來源普遍、危害龐大，并具有群發、迸發、宿主范圍廣、傳達速度快和社會影響劇烈、控制難度大等特點，是引發食品平安危害的重要要素，嚴重時會危及人類安康甚至社會安寧，形成龐大經濟損失。

檢測項目：

菌落總數、大腸菌群、霉菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、致病菌、志賀氏菌、空腸彎曲菌、商業無菌、乳酸菌等

檢測規范：

GB 4789.40-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 阪崎腸桿菌檢驗

GB 4789.7-2013食品平安規范 食品微生物學檢驗 副溶血性弧菌檢

GB 4789.13-2012食品平安規范 食品微生物學檢驗 產氣莢膜梭菌檢驗

GB 4789.2-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 菌落總數測定

GB 4789.38-2012食品平安規范 食品微生物學檢驗 大腸埃希氏菌計數

GB 4789.35-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 沙門氏菌檢驗

GB 4789.3-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 大腸菌群計數

GB 4789.35-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 乳酸菌檢驗

GB 4789.26-2013食品平安規范 食品微生物學檢驗 商業無菌檢驗

GB 4789.41-2016食品平安規范 食品微生物學檢驗 腸桿菌科檢驗

GB 4789.5-2012食品平安規范 食品微生物學檢驗 志賀氏菌檢驗

GB 4789.14-2014食品平安規范 食品微生物學檢驗 蠟樣芽胞桿菌檢驗